Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LHX9Q9NQ69 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LHX9Q9NQ69 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms