Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB9BQ9NP90 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB9BQ9NP90 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms