Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpusd4Q9CWX4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpusd4Q9CWX4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms