Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRIM55Q9BYV6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRIM55Q9BYV6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms