Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ49

SMIM7, Small integral membrane protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM7Q9BQ49 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM7Q9BQ49 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM7Q9BQ49 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.1 ms