Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM227BQ96M60 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM227BQ96M60 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms