Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A4AQ96JQ5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A4AQ96JQ5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms