Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LRRIQ1Q96JM4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LRRIQ1Q96JM4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
LRRIQ1Q96JM4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LRRIQ1Q96JM4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LRRIQ1Q96JM4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LRRIQ1Q96JM4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LRRIQ1Q96JM4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LRRIQ1Q96JM4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
LRRIQ1Q96JM4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LRRIQ1Q96JM4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LRRIQ1Q96JM4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
LRRIQ1Q96JM4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
LRRIQ1Q96JM4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
LRRIQ1Q96JM4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
LRRIQ1Q96JM4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
LRRIQ1Q96JM4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
LRRIQ1Q96JM4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
LRRIQ1Q96JM4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC31.9■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
LRRIQ1Q96JM4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC31.89■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.89■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
LRRIQ1Q96JM4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
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