Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EDC3Q96F86 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EDC3Q96F86 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms