Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GTF3C6Q969F1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GTF3C6Q969F1 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
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