Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPAP2Q8IXW5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RPAP2Q8IXW5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RPAP2Q8IXW5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAP2Q8IXW5 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms