Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ubash3bQ8BGG7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ubash3bQ8BGG7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.2 ms