Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NUP54Q7Z3B4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP54Q7Z3B4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms