Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HS2ST1Q7LGA3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HS2ST1Q7LGA3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms