Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RGMBQ6NW40 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RGMBQ6NW40 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms