Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C1orf220Q5T0J3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms