Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
VPS72Q15906 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VPS72Q15906 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms