Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE3CQ15386 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE3CQ15386 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
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