Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOFQ13790 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOFQ13790 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOFQ13790 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOFQ13790 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOFQ13790 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOFQ13790 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOFQ13790 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOFQ13790 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOFQ13790 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOFQ13790 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOFQ13790 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOFQ13790 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOFQ13790 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOFQ13790 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOFQ13790 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOFQ13790 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
APOFQ13790 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOFQ13790 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOFQ13790 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOFQ13790 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOFQ13790 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOFQ13790 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOFQ13790 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOFQ13790 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOFQ13790 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOFQ13790 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOFQ13790 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOFQ13790 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOFQ13790 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOFQ13790 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOFQ13790 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOFQ13790 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
APOFQ13790 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOFQ13790 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOFQ13790 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOFQ13790 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOFQ13790 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOFQ13790 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOFQ13790 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOFQ13790 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOFQ13790 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
APOFQ13790 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOFQ13790 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOFQ13790 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOFQ13790 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOFQ13790 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOFQ13790 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOFQ13790 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
APOFQ13790 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
APOFQ13790 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOFQ13790 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOFQ13790 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOFQ13790 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOFQ13790 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOFQ13790 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOFQ13790 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOFQ13790 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOFQ13790 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOFQ13790 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOFQ13790 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOFQ13790 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOFQ13790 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOFQ13790 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOFQ13790 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
APOFQ13790 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOFQ13790 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOFQ13790 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOFQ13790 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOFQ13790 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOFQ13790 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
APOFQ13790 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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