Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CAMK2BQ13554 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CAMK2BQ13554 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms