Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GRIK2Q13002 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GRIK2Q13002 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms