Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PTPN13Q12923 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN13Q12923 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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