Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCAPQ12770 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCAPQ12770 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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