Protein–RNA interactions for Protein: Q12220

DIP2, U3 small nucleolar RNA-associated protein 12, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DIP2Q12220 SUP8tY(GUA)M2 75 nt6.44□□□□□ -1.38
DIP2Q12220 SUP3tY(GUA)O 75 nt6.44□□□□□ -1.38
DIP2Q12220 YIR044CYIR044C 186 nt6.44□□□□□ -1.38
DIP2Q12220 DAL81YIR023W 2913 nt6.43□□□□□ -1.38
DIP2Q12220 YTA6YPL074W 2265 nt6.43□□□□□ -1.38
DIP2Q12220 MUS81YDR386W 1899 nt6.43□□□□□ -1.38
DIP2Q12220 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt6.43□□□□□ -1.38
DIP2Q12220 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt6.43□□□□□ -1.38
DIP2Q12220 RPS15YOL040C 429 nt6.43□□□□□ -1.38
DIP2Q12220 RRN6YBL014C 2685 nt6.43□□□□□ -1.38
DIP2Q12220 QCR7YDR529C 384 nt6.42□□□□□ -1.38
DIP2Q12220 TMN3YER113C 2121 nt6.42□□□□□ -1.38
DIP2Q12220 snR10snR10 245 nt6.42□□□□□ -1.38
DIP2Q12220 YBR277CYBR277C 402 nt6.42□□□□□ -1.38
DIP2Q12220 POL1YNL102W 4407 nt6.4□□□□□ -1.38
DIP2Q12220 DOA1YKL213C 2148 nt6.4□□□□□ -1.38
DIP2Q12220 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt6.4□□□□□ -1.38
DIP2Q12220 OLE1YGL055W 1533 nt6.4□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 NUP116YMR047C 3342 nt6.39□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 YRF1-4YLR466W 4149 nt6.39□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 FPR1YNL135C 345 nt6.39□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt6.39□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 ACM1YPL267W 630 nt6.39□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 GIP4YAL031C 2283 nt6.39□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 YAK1YJL141C 2424 nt6.39□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 RAD54YGL163C 2697 nt6.39□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 YEL043WYEL043W 2871 nt6.38□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 SOD1YJR104C 465 nt6.38□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 HEH2YDR458C 1992 nt6.38□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 SEG2YKL105C 3399 nt6.38□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 FAA1YOR317W 2103 nt6.37□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 TFC8YPL007C 1767 nt6.37□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 YER053C-AYER053C-A 114 nt6.37□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt6.37□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt6.37□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 PDR15YDR406W 4590 nt6.36□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 SMT3YDR510W 306 nt6.36□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 RPL20BYOR312C 519 nt6.36□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 BUL1YMR275C 2931 nt6.36□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 CDC20YGL116W 1833 nt6.36□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 SNU114YKL173W 3027 nt6.34□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 YKL050CYKL050C 2769 nt6.34□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt6.34□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 TGL4YKR089C 2733 nt6.34□□□□□ -1.39
DIP2Q12220 YDR089WYDR089W 2610 nt6.33□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 FOL1YNL256W 2475 nt6.33□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 AIM11YER093C-A 414 nt6.33□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 PRE4YFR050C 801 nt6.33□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 HSC82YMR186W 2118 nt6.33□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 PLC1YPL268W 2610 nt6.33□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 YPR003CYPR003C 2265 nt6.33□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 CFT2YLR115W 2580 nt6.32□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 KIC1YHR102W 3243 nt6.32□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 YGL069CYGL069C 465 nt6.32□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 SKT5YBL061C 2091 nt6.32□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 MSD1YPL104W 1977 nt6.31□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt6.31□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 PCA1YBR295W 3651 nt6.3□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 NPR1YNL183C 2373 nt6.3□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 YGL024WYGL024W 336 nt6.3□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 NAG1YGR031C-A 492 nt6.3□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 YIL174WYIL174W 228 nt6.3□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt6.3□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 YNL211CYNL211C 261 nt6.3□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 SIP3YNL257C 3690 nt6.3□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 COY1YKL179C 2040 nt6.3□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 RAD16YBR114W 2373 nt6.29□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 ALK2YBL009W 2031 nt6.29□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 YMR324CYMR324C 243 nt6.29□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 RPL21BYPL079W 483 nt6.29□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 snR45snR45 172 nt6.29□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 KRE6YPR159W 2163 nt6.28□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 HIR1YBL008W 2523 nt6.28□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt6.28□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 YOR218CYOR218C 420 nt6.28□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 PFK1YGR240C 2964 nt6.28□□□□□ -1.4
DIP2Q12220 YOR345CYOR345C 351 nt6.27□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 MGR2YPL098C 342 nt6.27□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 YGR266WYGR266W 2106 nt6.26□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 REG1YDR028C 3045 nt6.26□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 NUP2YLR335W 2163 nt6.26□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 YOR333CYOR333C 417 nt6.26□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 snR191snR191 274 nt6.26□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 SIR3YLR442C 2937 nt6.26□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 MSH1YHR120W 2880 nt6.25□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 MCM10YIL150C 1716 nt6.25□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 HFA1YMR207C 6372 nt6.25□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 YPR195CYPR195C 330 nt6.25□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 YPL260WYPL260W 1656 nt6.25□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 YGR125WYGR125W 3111 nt6.24□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 RPS17BYDR447C 411 nt6.24□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt6.24□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 EMC6YLL014W 327 nt6.24□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 UBC4YBR082C 447 nt6.24□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 VHS3YOR054C 2025 nt6.24□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 ZRG17YNR039C 1818 nt6.24□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 YDL176WYDL176W 2127 nt6.23□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 HFM1YGL251C 3564 nt6.23□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 DBP7YKR024C 2229 nt6.22□□□□□ -1.41
DIP2Q12220 OM14YBR230C 405 nt6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.6 ms