Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SSRP1Q08945 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SSRP1Q08945 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms