Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG1Q06432 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNG1Q06432 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms