Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
DSC2Q02487 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
DSC2Q02487 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms