Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TNFRSF17Q02223 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms