Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EXOSC10Q01780 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC10Q01780 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms