Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERVK_113P62684 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113P62684 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms