Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUP107P57740 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP107P57740 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP107P57740 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP107P57740 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP107P57740 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP107P57740 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP107P57740 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP107P57740 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP107P57740 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP107P57740 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP107P57740 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP107P57740 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP107P57740 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP107P57740 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP107P57740 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NUP107P57740 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NUP107P57740 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NUP107P57740 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP107P57740 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP107P57740 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP107P57740 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP107P57740 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP107P57740 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP107P57740 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP107P57740 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP107P57740 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP107P57740 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP107P57740 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP107P57740 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP107P57740 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP107P57740 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP107P57740 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NUP107P57740 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms