Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
EPHB3P54753 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms