Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP11P51784 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP11P51784 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP11P51784 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP11P51784 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP11P51784 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP11P51784 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP11P51784 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP11P51784 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP11P51784 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP11P51784 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP11P51784 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP11P51784 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP11P51784 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP11P51784 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP11P51784 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP11P51784 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP11P51784 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP11P51784 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP11P51784 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP11P51784 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP11P51784 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP11P51784 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP11P51784 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP11P51784 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP11P51784 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP11P51784 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP11P51784 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP11P51784 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP11P51784 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP11P51784 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP11P51784 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP11P51784 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP11P51784 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP11P51784 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP11P51784 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP11P51784 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP11P51784 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP11P51784 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP11P51784 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP11P51784 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP11P51784 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP11P51784 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP11P51784 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP11P51784 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP11P51784 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP11P51784 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP11P51784 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP11P51784 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP11P51784 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP11P51784 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP11P51784 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP11P51784 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP11P51784 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP11P51784 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP11P51784 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP11P51784 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP11P51784 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP11P51784 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP11P51784 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP11P51784 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP11P51784 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP11P51784 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
USP11P51784 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP11P51784 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP11P51784 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP11P51784 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP11P51784 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP11P51784 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
USP11P51784 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP11P51784 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP11P51784 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP11P51784 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP11P51784 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP11P51784 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP11P51784 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP11P51784 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP11P51784 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
USP11P51784 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP11P51784 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP11P51784 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP11P51784 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP11P51784 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP11P51784 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP11P51784 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP11P51784 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP11P51784 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP11P51784 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
USP11P51784 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
USP11P51784 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP11P51784 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP11P51784 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP11P51784 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP11P51784 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP11P51784 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP11P51784 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP11P51784 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP11P51784 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
USP11P51784 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
USP11P51784 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms