Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXA13P31271 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXA13P31271 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms