Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HOXA7P31268 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXA7P31268 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms