Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
EPHA1P21709 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
EPHA1P21709 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms