Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYT1P21579 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT1P21579 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT1P21579 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT1P21579 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT1P21579 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT1P21579 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT1P21579 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT1P21579 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT1P21579 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT1P21579 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT1P21579 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT1P21579 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT1P21579 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT1P21579 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT1P21579 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYT1P21579 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT1P21579 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT1P21579 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT1P21579 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT1P21579 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT1P21579 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT1P21579 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT1P21579 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT1P21579 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT1P21579 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT1P21579 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYT1P21579 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT1P21579 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT1P21579 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT1P21579 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT1P21579 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT1P21579 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT1P21579 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT1P21579 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT1P21579 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT1P21579 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT1P21579 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT1P21579 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT1P21579 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT1P21579 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT1P21579 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYT1P21579 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT1P21579 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT1P21579 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT1P21579 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT1P21579 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT1P21579 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT1P21579 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT1P21579 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT1P21579 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT1P21579 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT1P21579 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT1P21579 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT1P21579 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT1P21579 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT1P21579 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT1P21579 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT1P21579 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT1P21579 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT1P21579 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYT1P21579 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYT1P21579 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms