Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RD3LP0DJH9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RD3LP0DJH9 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms