Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD4P01730 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD4P01730 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD4P01730 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD4P01730 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD4P01730 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD4P01730 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD4P01730 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD4P01730 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD4P01730 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD4P01730 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD4P01730 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD4P01730 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD4P01730 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD4P01730 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD4P01730 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD4P01730 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD4P01730 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD4P01730 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD4P01730 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD4P01730 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD4P01730 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD4P01730 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD4P01730 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD4P01730 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD4P01730 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD4P01730 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD4P01730 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD4P01730 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CD4P01730 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD4P01730 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD4P01730 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD4P01730 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD4P01730 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD4P01730 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CD4P01730 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD4P01730 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD4P01730 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD4P01730 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD4P01730 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD4P01730 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD4P01730 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD4P01730 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD4P01730 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD4P01730 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD4P01730 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD4P01730 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD4P01730 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD4P01730 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD4P01730 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD4P01730 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD4P01730 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD4P01730 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CD4P01730 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD4P01730 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD4P01730 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD4P01730 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CD4P01730 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CD4P01730 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD4P01730 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD4P01730 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD4P01730 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD4P01730 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD4P01730 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD4P01730 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD4P01730 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD4P01730 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD4P01730 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD4P01730 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD4P01730 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD4P01730 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD4P01730 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD4P01730 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD4P01730 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms