Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLR1AO95602 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
POLR1AO95602 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms