Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP19O94966 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP19O94966 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP19O94966 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP19O94966 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
USP19O94966 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP19O94966 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP19O94966 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP19O94966 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP19O94966 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP19O94966 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
USP19O94966 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
USP19O94966 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP19O94966 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP19O94966 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP19O94966 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP19O94966 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP19O94966 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP19O94966 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP19O94966 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP19O94966 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP19O94966 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP19O94966 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP19O94966 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP19O94966 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP19O94966 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP19O94966 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP19O94966 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
USP19O94966 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP19O94966 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP19O94966 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP19O94966 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP19O94966 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP19O94966 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP19O94966 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP19O94966 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
USP19O94966 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
USP19O94966 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP19O94966 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP19O94966 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP19O94966 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP19O94966 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP19O94966 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP19O94966 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP19O94966 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP19O94966 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP19O94966 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP19O94966 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP19O94966 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP19O94966 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP19O94966 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
USP19O94966 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP19O94966 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP19O94966 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP19O94966 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP19O94966 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP19O94966 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP19O94966 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP19O94966 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP19O94966 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP19O94966 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP19O94966 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP19O94966 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP19O94966 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP19O94966 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP19O94966 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
USP19O94966 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP19O94966 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP19O94966 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP19O94966 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP19O94966 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP19O94966 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP19O94966 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP19O94966 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP19O94966 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP19O94966 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP19O94966 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP19O94966 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP19O94966 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP19O94966 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP19O94966 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP19O94966 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP19O94966 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP19O94966 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP19O94966 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP19O94966 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP19O94966 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP19O94966 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP19O94966 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP19O94966 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP19O94966 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP19O94966 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP19O94966 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms