Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMDSO60547 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMDSO60547 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMDSO60547 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GMDSO60547 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMDSO60547 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMDSO60547 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMDSO60547 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMDSO60547 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GMDSO60547 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMDSO60547 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMDSO60547 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMDSO60547 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMDSO60547 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMDSO60547 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GMDSO60547 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMDSO60547 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMDSO60547 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMDSO60547 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMDSO60547 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMDSO60547 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMDSO60547 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMDSO60547 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GMDSO60547 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GMDSO60547 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GMDSO60547 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GMDSO60547 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GMDSO60547 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GMDSO60547 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GMDSO60547 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GMDSO60547 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GMDSO60547 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GMDSO60547 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GMDSO60547 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GMDSO60547 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GMDSO60547 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GMDSO60547 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GMDSO60547 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GMDSO60547 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GMDSO60547 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GMDSO60547 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms