Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
EFNA2O43921 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA2O43921 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA2O43921 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
EFNA2O43921 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms