Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ARPC1BO15143 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ARPC1BO15143 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms