Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ANKRD28O15084 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD28O15084 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD28O15084 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD28O15084 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD28O15084 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD28O15084 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD28O15084 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD28O15084 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD28O15084 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ANKRD28O15084 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms