Protein–RNA interactions for Protein: B1AJZ1

C1orf196, Putative uncharacterized protein C1orf196, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf196B1AJZ1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf196B1AJZ1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf196B1AJZ1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf196B1AJZ1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf196B1AJZ1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf196B1AJZ1 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf196B1AJZ1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf196B1AJZ1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf196B1AJZ1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf196B1AJZ1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf196B1AJZ1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf196B1AJZ1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf196B1AJZ1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf196B1AJZ1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf196B1AJZ1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C1orf196B1AJZ1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1orf196B1AJZ1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1orf196B1AJZ1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1orf196B1AJZ1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1orf196B1AJZ1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1orf196B1AJZ1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C1orf196B1AJZ1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C1orf196B1AJZ1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms