Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.1
U3KQE9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQE9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQE9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQE9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQE9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQE9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQE9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQE9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQE9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQE9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQE9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQE9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQE9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQE9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQE9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQE9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQE9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQE9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQE9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQE9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQE9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQE9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
U3KQE9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
U3KQE9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
U3KQE9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
U3KQE9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms