Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SORCS3Q9UPU3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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