Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCAF8Q9UPN6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCAF8Q9UPN6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms