Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PNMA8BQ9ULN7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms